Không dùng thuốc cho người bệnh có tiền sử dị ứng với kháng sinh nhóm cephalosporin, người bệnh có tiền sử sốc phản vệ do penicilin hoặc phản ứng trầm trọng khác qua trung gian globulin miễn dịch IgE.

Một số tác dụng không mong muốn của thuốc có thể xảy ra cho người sử dụng. Tiêu chảy và buồn nôn là hai triệu chứng thường gặp nhất. Nếu bị tiêu chảy hoặc có máu ở trong phân, người bệnh cần gọi ngay cho bác sĩ, không được sử dụng bất kỳ loại thuốc nào để cầm tiêu chảy (vì đây rất có thể là dấu hiệu của một nhiễm trùng mới) trừ khi có ý kiến của thầy thuốc.

Ngoài hai dấu hiệu trên, người sử dụng có thể bị nổi ban, mày đay, ngứa. Ðã có thông báo về những triệu chứng thần kinh trung ương như chóng mặt, lú lẫn, kích động và ảo giác (nhưng chưa hoàn toàn chứng minh được mối liên quan với cefalexin). Nặng hơn là dị ứng hồng ban đa dạng, hoại tử biểu bì nhiễm độc (hội chứng Lyell), phù Quincke, hội chứng Stevens - Johnson... Nếu xảy ra các phản ứng dị ứng trên cần ngừng thuốc. Cần có sự trợ giúp khẩn cấp của y tế nếu có bất kỳ dấu hiệu của một phản ứng dị ứng với cefalexin như phát ban, khó thở, sưng mặt, môi, lưỡi hoặc họng.